DNA（脱氧核糖核酸）和蛋白质是两种在生物体内扮演不同角色的重要生物分子，它们之间的根本区别主要体现在以下几个方面：

1. **化学组成**：
- DNA由四种碱基（腺嘌呤A、鸟嘌呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T）、磷酸和脱氧核糖组成。
- 蛋白质则由20种不同的氨基酸通过肽键连接而成。

2. **功能**：
- DNA的主要功能是存储遗传信息。它决定了生物体的遗传特征，并指导细胞内所有其他分子的合成。
- 蛋白质执行着生命活动中几乎所有的功能，包括催化生化反应的酶、提供结构支持的纤维蛋白、运输物质的载体蛋白、以及参与信号传递的受体蛋白等。

3. **结构**：
- DNA通常以双螺旋结构存在，两条互补的链相互缠绕。
- 蛋白质可以折叠成非常复杂多样的三维结构，这些结构决定了其特定的功能。

4. **复制与合成**：
- DNA能够自我复制，确保遗传信息可以在细胞分裂时准确地传递给子代细胞。
- 蛋白质不能自我复制，它们是在DNA的指导下通过转录和翻译过程由细胞内的核糖体合成出来的。

5. **稳定性**：
- 在一般条件下，DNA比大多数蛋白质更稳定，不容易被环境因素破坏。
- 蛋白质对温度、pH值等环境条件较为敏感，容易变性或失活。

综上所述，尽管DNA和蛋白质都是生命体不可或缺的组成部分，但它们在化学组成、功能、结构、合成方式以及稳定性等方面存在着显著差异。