初级农业生产合作社确实具有社会主义的萌芽性质。这种合作社是中国农业社会主义改造过程中的一个重要阶段，它是在国家的引导和支持下，农民自愿加入的一种合作经济组织。在这个阶段，土地等生产资料仍然归农民个人所有，但农民会将土地的经营权交给合作社统一管理，并按照劳动贡献参与分配。这种方式体现了从个体经济向集体经济过渡的特点，为后续的高级农业生产合作社和人民公社化运动奠定了基础。

因此，选项A“社会主义的萌芽性质”是正确的。