要理解这个问题，我们首先需要了解一些基本的生物化学概念。蛋白质是由氨基酸通过肽键连接起来的大分子。每两个氨基酸之间通过一个肽键相连，形成一条肽链。在形成肽链的过程中，每个肽键都会导致失去一分子水（脱水缩合反应）。如果一个蛋白质由n个氨基酸形成，并且形成了2条肽链，我们可以根据这些信息进行一些计算。

1. **肽键数量**：由于形成肽链时每两个氨基酸间形成一个肽键，那么n个氨基酸会形成\(n-1\)个肽键。但这里需要注意的是，这个公式适用于单肽链的情况。对于多肽链（本题中是两条肽链），我们需要考虑每条肽链内部的肽键数以及肽链之间的连接方式。实际上，两条肽链之间的连接并不通过肽键来实现，而是可能通过其他类型的化学键或非共价作用力。因此，对于两条肽链，总共有\(n-2\)个肽键（假设这两条肽链是由同一个长链经过切割形成的）。

2. **自由氨基和羧基的数量**：在氨基酸形成肽链时，每个氨基酸有一个氨基(-NH2)和一个羧基(-COOH)，但是当它们通过肽键连接时，这些基团中的一个会被消耗掉。对于单肽链而言，只会在链的一端保留一个游离的氨基，在另一端保留一个游离的羧基。然而，对于多肽链来说，每增加一条肽链，理论上就会多出一个游离的氨基和一个游离的羧基。所以，在这种情况下，会有\(至少2\)个游离的氨基和\(至少2\)个游离的羧基（假设每条肽链都有一个游离的氨基和一个游离的羧基）。

总结来说，对于一个由n个氨基酸形成的2条肽链的蛋白质：
- 肽键的数量为\(n-2\)
- 至少有2个游离的氨基和2个游离的羧基

请注意，这里的分析基于理想情况下的假设，实际情况可能会因为蛋白质的具体结构和后修饰过程而有所不同。