维持蛋白质二级结构的主要化学键是氢键。蛋白质的二级结构包括α-螺旋和β-折叠等构象，这些结构主要是通过多肽链主链上的羰基（C=O）与氨基（N-H）之间的氢键相互作用来稳定。这些氢键在多肽链内部形成，连接不同肽键上的原子，从而帮助确定蛋白质的局部三维形状。需要注意的是，虽然氢键是主要的作用力，但其他因素如电荷相互作用、疏水效应等也对蛋白质的二级结构有一定影响。