明朝初年强化君主专制的措施主要包括：

1. 废除丞相制度：明太祖朱元璋在洪武十三年（1380年）废除了丞相职位，将宰相权力分散至六部尚书，从而加强了皇帝对国家政务的直接控制。

2. 建立锦衣卫和东厂等特务机构：这些机构直接听命于皇帝，负责监视臣民，收集情报，镇压反对势力，以巩固皇权。

3. 强化科举制度：通过严格的科举考试选拔官员，确保官僚体系对皇权的忠诚度，同时削弱贵族和世袭官员的影响。

4. 实行八股取士：规定科举考试必须采用固定的文体格式（即八股文），以此来控制思想文化领域，防止异端学说的传播。

5. 修建长城与海防：虽然这主要是军事防御工程，但也体现了中央集权下国家动员能力和资源调配能力的增强。